Protein–RNA interactions for Protein: Q9D552

Spata17, Spermatogenesis-associated protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata17Q9D552 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spata17Q9D552 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spata17Q9D552 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spata17Q9D552 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Spata17Q9D552 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms