Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox2aQ9D4Y3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rhox2aQ9D4Y3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms