Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V6

Tomm20l, TOMM20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20lQ9D4V6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tomm20lQ9D4V6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tomm20lQ9D4V6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tomm20lQ9D4V6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tomm20lQ9D4V6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tomm20lQ9D4V6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms