Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4930578G10RikQ9D4Q4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4930578G10RikQ9D4Q4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms