Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf6Q9D4J7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms