Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lonrf3Q9D4H7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Lonrf3Q9D4H7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms