Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcc1Q9D4H2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcc1Q9D4H2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcc1Q9D4H2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcc1Q9D4H2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcc1Q9D4H2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcc1Q9D4H2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcc1Q9D4H2 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcc1Q9D4H2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcc1Q9D4H2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcc1Q9D4H2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcc1Q9D4H2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcc1Q9D4H2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcc1Q9D4H2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcc1Q9D4H2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcc1Q9D4H2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcc1Q9D4H2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcc1Q9D4H2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcc1Q9D4H2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcc1Q9D4H2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcc1Q9D4H2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gcc1Q9D4H2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gcc1Q9D4H2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gcc1Q9D4H2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gcc1Q9D4H2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gcc1Q9D4H2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gcc1Q9D4H2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gcc1Q9D4H2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gcc1Q9D4H2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gcc1Q9D4H2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms