Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4933428M09RikQ9D3X3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4933428M09RikQ9D3X3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms