Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus10Q9D3U0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus10Q9D3U0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms