Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx20Q9D2Y5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx20Q9D2Y5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx20Q9D2Y5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx20Q9D2Y5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx20Q9D2Y5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx20Q9D2Y5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx20Q9D2Y5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx20Q9D2Y5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx20Q9D2Y5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx20Q9D2Y5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx20Q9D2Y5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx20Q9D2Y5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx20Q9D2Y5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx20Q9D2Y5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx20Q9D2Y5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx20Q9D2Y5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx20Q9D2Y5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx20Q9D2Y5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx20Q9D2Y5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx20Q9D2Y5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx20Q9D2Y5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms