Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vsig1Q9D2J4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vsig1Q9D2J4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms