Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pramef12Q9D2F1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms