Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bcas2Q9D287 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bcas2Q9D287 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms