Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chordc1Q9D1P4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chordc1Q9D1P4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms