Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Susd3Q9D176 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Susd3Q9D176 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Susd3Q9D176 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Susd3Q9D176 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Susd3Q9D176 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Susd3Q9D176 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Susd3Q9D176 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Susd3Q9D176 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Susd3Q9D176 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Susd3Q9D176 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Susd3Q9D176 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Susd3Q9D176 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Susd3Q9D176 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Susd3Q9D176 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Susd3Q9D176 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Susd3Q9D176 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Susd3Q9D176 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Susd3Q9D176 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Susd3Q9D176 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Susd3Q9D176 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Susd3Q9D176 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Susd3Q9D176 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Susd3Q9D176 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Susd3Q9D176 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Susd3Q9D176 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Susd3Q9D176 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms