Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tmem53Q9D0Z3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms