Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Tmem88Q9D0N8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Tmem88Q9D0N8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Tmem88Q9D0N8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Tmem88Q9D0N8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Tmem88Q9D0N8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Tmem88Q9D0N8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tmem88Q9D0N8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tmem88Q9D0N8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Tmem88Q9D0N8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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