Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Zbed3Q9D0L1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Zbed3Q9D0L1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms