Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2e1Q9D0D5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms