Protein–RNA interactions for Protein: Q9D099

Acer3, Alkaline ceramidase 3, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acer3Q9D099 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Acer3Q9D099 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Acer3Q9D099 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms