Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc47Q9D024 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc47Q9D024 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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