Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rab3bQ9CZT8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Rab3bQ9CZT8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms