Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Thumpd2Q9CZB3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms