Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nde1Q9CZA6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nde1Q9CZA6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms