Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ChtopQ9CY57 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ChtopQ9CY57 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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