Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2fQ9CY34 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2fQ9CY34 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms