Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Bud23Q9CY21 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bud23Q9CY21 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms