Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Snx7Q9CY18 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx7Q9CY18 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx7Q9CY18 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx7Q9CY18 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx7Q9CY18 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx7Q9CY18 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx7Q9CY18 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx7Q9CY18 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx7Q9CY18 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Snx7Q9CY18 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx7Q9CY18 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx7Q9CY18 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx7Q9CY18 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx7Q9CY18 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx7Q9CY18 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx7Q9CY18 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Snx7Q9CY18 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms