Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CXL3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CXL3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CXL3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CXL3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CXL3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CXL3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CXL3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q9CXL3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CXL3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q9CXL3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms