Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Sgo1Q9CXH7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sgo1Q9CXH7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Sgo1Q9CXH7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sgo1Q9CXH7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sgo1Q9CXH7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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