Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmed5Q9CXE7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmed5Q9CXE7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms