Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc3Q9CXE6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc3Q9CXE6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc3Q9CXE6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc3Q9CXE6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc3Q9CXE6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc3Q9CXE6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Xrcc3Q9CXE6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc3Q9CXE6 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc3Q9CXE6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc3Q9CXE6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc3Q9CXE6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc3Q9CXE6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc3Q9CXE6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Xrcc3Q9CXE6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Xrcc3Q9CXE6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Xrcc3Q9CXE6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Xrcc3Q9CXE6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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Xrcc3Q9CXE6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Xrcc3Q9CXE6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Xrcc3Q9CXE6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Xrcc3Q9CXE6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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Xrcc3Q9CXE6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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Xrcc3Q9CXE6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Xrcc3Q9CXE6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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