Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Cnih4Q9CX13 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Cnih4Q9CX13 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cnih4Q9CX13 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cnih4Q9CX13 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cnih4Q9CX13 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cnih4Q9CX13 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Cnih4Q9CX13 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cnih4Q9CX13 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Cnih4Q9CX13 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cnih4Q9CX13 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cnih4Q9CX13 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cnih4Q9CX13 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cnih4Q9CX13 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Cnih4Q9CX13 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cnih4Q9CX13 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms