Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Utp23Q9CX11 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms