Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ist1Q9CX00 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ist1Q9CX00 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms