Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RpainQ9CWY9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RpainQ9CWY9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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