Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU9

Nup37, Nucleoporin Nup37, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup37Q9CWU9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup37Q9CWU9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup37Q9CWU9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nup37Q9CWU9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup37Q9CWU9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup37Q9CWU9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup37Q9CWU9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup37Q9CWU9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup37Q9CWU9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup37Q9CWU9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup37Q9CWU9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup37Q9CWU9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup37Q9CWU9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup37Q9CWU9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup37Q9CWU9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nup37Q9CWU9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nup37Q9CWU9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup37Q9CWU9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nup37Q9CWU9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup37Q9CWU9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms