Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snx10Q9CWT3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms