Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR41

Hypk, Huntingtin-interacting protein K, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HypkQ9CR41 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HypkQ9CR41 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HypkQ9CR41 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms