Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4931417E11RikQ9CR05 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms