Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX0

Otub2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otub2Q9CQX0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Otub2Q9CQX0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Otub2Q9CQX0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms