Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ykt6Q9CQW1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ykt6Q9CQW1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ykt6Q9CQW1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ykt6Q9CQW1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ykt6Q9CQW1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ykt6Q9CQW1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ykt6Q9CQW1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ykt6Q9CQW1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ykt6Q9CQW1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ykt6Q9CQW1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ykt6Q9CQW1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ykt6Q9CQW1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ykt6Q9CQW1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ykt6Q9CQW1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ykt6Q9CQW1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ykt6Q9CQW1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ykt6Q9CQW1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ykt6Q9CQW1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ykt6Q9CQW1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ykt6Q9CQW1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ykt6Q9CQW1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ykt6Q9CQW1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ykt6Q9CQW1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ykt6Q9CQW1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ykt6Q9CQW1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ykt6Q9CQW1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ykt6Q9CQW1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ykt6Q9CQW1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ykt6Q9CQW1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ykt6Q9CQW1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms