Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT1

Mri1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mri1Q9CQT1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mri1Q9CQT1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms