Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE0

Rnf138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138Q9CQE0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf138Q9CQE0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf138Q9CQE0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf138Q9CQE0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf138Q9CQE0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf138Q9CQE0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf138Q9CQE0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf138Q9CQE0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf138Q9CQE0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf138Q9CQE0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf138Q9CQE0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf138Q9CQE0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf138Q9CQE0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf138Q9CQE0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf138Q9CQE0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf138Q9CQE0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf138Q9CQE0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf138Q9CQE0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf138Q9CQE0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf138Q9CQE0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf138Q9CQE0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms