Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sar1bQ9CQC9 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms