Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ubl4bQ9CQ84 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ubl4bQ9CQ84 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms