Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkp2Q9CQ73 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms