Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpa3Q9CQ71 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpa3Q9CQ71 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms