Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ39

Med21, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 21, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med21Q9CQ39 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Med21Q9CQ39 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med21Q9CQ39 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med21Q9CQ39 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med21Q9CQ39 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med21Q9CQ39 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med21Q9CQ39 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med21Q9CQ39 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med21Q9CQ39 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med21Q9CQ39 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Med21Q9CQ39 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med21Q9CQ39 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med21Q9CQ39 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med21Q9CQ39 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med21Q9CQ39 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med21Q9CQ39 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med21Q9CQ39 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med21Q9CQ39 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med21Q9CQ39 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med21Q9CQ39 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med21Q9CQ39 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med21Q9CQ39 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med21Q9CQ39 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med21Q9CQ39 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med21Q9CQ39 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med21Q9CQ39 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med21Q9CQ39 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Med21Q9CQ39 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms