Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Chmp3Q9CQ10 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Chmp3Q9CQ10 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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